Post by Duygu İrem ÖZGER
Intern Molecular Biologist
Değerli bağlantılarım, Büyük bir heyecanla ve gururla paylaşmak isterim ki; yürütücülüğünü ve çalışmasını üstlendiğim "FGFR3-S249C Mutant Mesane Kanseri Hedefli Küçük Molekül İnhibisyonu: Moleküler Dinamik Simülasyonu ve Ligand Tasarım Yaklaşımı" başlıklı projem, TÜBİTAK 2209-A Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı kapsamında desteklenmeye hak kazandı! 🚀🔬 Projemde, mesane kanserinde sıkça karşılaştığımız FGFR3-S249C nokta mutasyonunu hedefleyerek mutasyona özgü küçük molekül inhibitörlerini in silico yöntemlerle tasarlamayı amaçlıyor ve derin öğrenme destekli ligand üretimi (REINVENT) ve moleküler dinamik simülasyonlarını (NAMD, VMD) entegre eden bu yaklaşımla, literatüre katkı sağlayacak ve ilaç keşfi süreçlerine yeni bir şablon sunacak aday moleküller belirlemeyi hedefliyorum. 💻🧬 Bu süreçte engin bilgi ve tecrübeleriyle bana yol gösteren, vizyonuyla ufkumu açan çok değerli danışman hocam Aslı Kutlu ve bana bu yolda çok büyük destekleri olan Kaan Adacan, Buse Meriç Açar’a sonsuz teşekkürlerimi sunarım. 🙏🏻 Hesaplamalı biyoloji, yapısal biyoinformatik ve moleküler modelleme alanlarındaki çalışmalarımı bir adım öteye taşıyacağım bu araştırma serüveni için çok heyecanlıyım. Süreç boyunca elde edeceğimiz bulguları ve proje çıktılarımızı ilerleyen dönemde sizlerle paylaşmak için sabırsızlanıyorum! 🌟 English.. I am thrilled and honored to share that my undergraduate research project, "Small Molecule Inhibition Targeting FGFR3-S249C Mutant Bladder Cancer: Molecular Dynamics Simulation and Ligand Design Approach," has been awarded the TÜBİTAK 2209-A Research Grant! 🚀🔬 In this project, we aim to design mutation-specific small molecule inhibitors in silico by integrating deep learning-based ligand generation (REINVENT) with molecular dynamics simulations (NAMD, VMD). Our goal is to contribute to the literature and provide a novel computational pipeline for drug discovery. 💻🧬 A huge thank you to my esteemed advisor Aslı Kutlu for her invaluable guidance and vision, and to Kaan Adacan, Buse Meriç Açar for their continuous support. 🙏🏻 I am incredibly excited to advance my work in computational biology, structural bioinformatics, and molecular modeling through this journey!