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Recherche un emploi: Ingénieur R&D biologie en particulier dans le domaine de l'oncogénétique, mais reste ouverte à toutes autres propositions dans mon domaine.
Gestion de plateforme de biologie moléculaire au sein de l’unité UMS 2700 -2AD, dans le Service de Systématique Moléculaire (SSM)
- Elaboration d’un panel de recherches de mutations sur les deux principaux cancers primitifs du foie : le carcinome hépatocellulaire et le cholangiocarcinome, dans le but d’améliorer la détection précoce du cancer du foie chez les personnes à risques et ainsi leur prise en charge. - Utilisation de données bibliographiques et de bases publiques pour identifier les cibles. - Mise en place du séquençage de l’ADN 16S, pour l’étude du microbiote intestinal et son rôle dans la promotion tumorale. Extraction de fèces. Préparation des librairies de type amplicons de l’ADN 16S région V3-V4. Dans un premier temps, pour caractériser nos modèles animaux de carcinogénèse, et pouvoir par la suite transférer ces améliorations dans un projet transversal visant à étudier l’impact du microbiote chez des patients atteint de carcinome hépatocellulaire.
Aide à la mise en place de nouveaux automates (Miseq, Extracteur d’ADN,...). Gestion organisationnelle de l’utilisation du Miseq sur la plateforme oncogénétique. Développement de l’activité génétique somatique des tumeurs solides pour augmenter le nombre de bio-marqueurs génétiques recherchés. Développement d’un panel pour l’analyse de la méthylation de l’ADN du gène BRCA1, et d'autres gènes tels que hMLH1 et MGMT. (Agena) Mise en place du NGS (Séquençage de nouvelle génération) pour l’analyse d’anomalies génétiques somatiques des gènes BRCA, pour un panel tumeurs solides et pour un panel myéloïdes à visée thérapeutique. Préparation de librairies amplicons (Illumina, Multiplicom, Qiagen) et captures (Sophia Genetics - kit KAPA).
Réception, validation et contrôle de la conformité des prélèvements et, enregistrement des demandes d’examens de biologie. Traitement pré-analytique des échantillons (Extraction ADN de tumeurs solides ou de biopsies liquides) sur QIAsymphony. Mise en œuvre des techniques d’analyse - Recherche de mutations par technique HRM (High Resolution Melting) ou PCR multiplex et Spectrométrie de Masse sur Massarray (Agena), Séquençage, Analyse de fragments. Maintenance courante préventive et/ou corrective des analyseurs et des systèmes d’analyse, Gestion des stocks et/ou des commandes de réactifs et de consommables Gestion et Traitement des prélèvements en hématologie. Extraction ARN/ADN. PCR quantitative Jak2 V617F – des transcrits majeurs Bcr/Abl. Séquençage de type Sanger.
Screening de produits ex-vivo à partir d’échantillons prélevés chez la souris en vue d’identifier des molécules d’intérêts. Culture cellulaire de différentes lignées adhérentes et non adhérentes. Lyse de tumeurs par Precellys/extraction de protéines. Lyse de cellules/extraction de protéines. Dosage de protéines. Utilisation de plaque de 96 puits, Meso Scale Discovery Phosphoprotein Assays permettant de mesurer les niveaux de protéines d’intérêts.