Mainz, Rhineland-Palatinate, Germany
Als Mitglied der Core Facility Bioinformatik am Institut für Molekulare Biologie (IMB) in Mainz unterstütze ich Wissenschaftler am IMB und an der Universität Mainz bei der Prozessierung, Analyse und Interpretation der Daten verschiedener NGS-Technologien.
Das Forschungsinteresse unserer Arbeitsgruppe liegt in der Aufklärung der genetischen Grundlagen von Herz-Kreislauf-Erkrankungen wie Herzinsuffizienz, Arteriosklerose, Schlaganfall, etc. In unserer Illumina-basierten Genomics-Core Facility erheben wir im Verbund mit Klinikern und anderen Forschungsgruppen die dazu nötigen Daten mittels verschiedener Microarray- und Next Generation Sequencing-Technologien. Ein wichtiger Aspekt meiner Tätigkeit ist die Integration und die statistische Auswertung der biologischen Omics-Daten mit Hilfe der Programmierumgebung R/Bioconductor. Hierfür habe ich eine modulare Analyse-Pipeline erstellt und auf GitHub unter 'https://github.com/ frankRuehle/systemsbio' öffentlich zur Verfügung gestellt. Ein weiterer Forschungsschwerpunkt liegt in der Erforschung von langen, nicht-kodierenden RNA-Molekülen (lncRNAs) im Hinblick auf ihre Eignung als potentielle Biomarker in Herz-Kreislauf-Erkrankungen.
Ziel des Leibniz-Institutes für Arterioskleroseforschung an der Westfälischen Wilhelms-Universität Münster war die Erforschung der Entstehung, Verhütung und Behandlung der Arteriosklerose. In unserem Department „Genetische Epidemiologie vaskulärer Erkrankungen“ von Prof. Dr. Monika Stoll haben wir im Verbund mit anderen Forschungsgruppen und Klinikern die genetischen Grundlagen von Herz-Kreislauf-Erkrankungen untersucht. Meine Tätigkeitsschwerpunkte umfassten dabei die statistische Auswertung von genomweiten Assoziationsstudien (GWAS) und deren Vereinigung in Meta-Analysen, die Auswertung von Genexpressions- und Epigenetik-Studien sowie die Analyse systembiologischer Netzwerke. Ferner gehörten Lehre, die Betreuung studentischer Bachelor- und Masterarbeiten und die die Leitung eines DNA-Analytik Labors zu meinen Aufgaben.